Obwohl Unreal Commander Freeware ist, verfügt es über ein Lizenzverwaltungssystem. Sie können über das Menü Hilfe darauf zugreifen, um Ihre SystemID zu erhalten, mit der Sie einen kostenlosen Lizenzschlüssel von der offiziellen Website erhalten können. Der Lizenzschlüssel läuft in 25 Tagen ab, kann jedoch so eingestellt werden, dass er automatisch aktualisiert wird.